Tổng thầu EPC vẫn chưa xây dựng phương án an toàn cho dự án. Nên phía chủ đầu tư không đồng ý cho Tổng thầu thực hiện vận hành thử toàn hệ thống. Do đó, tới nay dự án vẫn chưa thể vận hành thử.
Tại cuộc họp báo Chính phủ thường kì tháng 9 vừa diễn ra, đại diện Bộ GTVT đã chỉ ra những tồn tại của dự án đường sắt Cát Linh – Hà Đông khiến dự án này chưa thể đưa vào vận hành.